Každý rok vydává Finanční správa České republiky výroční zprávu, která shrnuje její činnost v uplynulém roce. Výroční zpráva ukazuje, na co se finanční správa zaměřuje, jaké nové nástroje využívá a jaké trendy lze očekávat v oblasti správy daní. Přinášíme vám výběr vybraných informací z výroční zprávy za rok 2025.
Finanční správa v roce 2024 spustila projekt Daňové echo, který má za cíl neformální cestou upozornit daňové subjekty na nesrovnalosti v jejich daňových přiznáních. Výhodou tohoto nástroje je, že umožňuje dobrovolnou nápravu zjištěných nesrovnalostí ještě před zahájením formálních kontrolních postupů. Prozatím se Daňové echo zaměřovalo na nedostatky související s daní z příjmů fyzických osob, přičemž se poslední etapa Daňového echa z prosince 2025 týkala povinnosti přiznat příjmy z hazardních her, zatímco předchozí etapy mířily například na nesprávně uplatněné slevy na manžela či manželku. Na základě prvních dvou etap Daňového echa bylo dobrovolně přiznáno více než 52,3 milionu Kč. Výsledky projektu naznačují, že finanční správa bude Daňové echo využívat i nadále.
Finanční správa se často nechává slyšet, že díky pokročilým analytickým nástrojům vykonává kontroly rok od roku efektivněji. V roce 2025 provedla oproti roku 2024 o 11,3 % méně daňových kontrol, ale přesto se objem doměrků zvýšil o 1,2 miliardy Kč. Z výroční zprávy přitom vyplývá, že se na vyšších doměrcích podílely všechny tři hlavní daně – DPH i daně z příjmů fyzických a právnických osob.
V praxi to znamená, že pokud je u vás zahájena daňová kontrola, zpravidla nejde o náhodný výběr. Finanční správa často vychází z konkrétních rizik identifikovaných prostřednictvím svých analytických nástrojů.
V roce 2025 se finanční správa zaměřovala zejména na odhalování nesouladů mezi údaji vykázanými v jednotlivých daňových přiznáních. Kontrolovala například soulad údajů uvedených v kontrolních hlášeních a přiznáních k DPH s údaji vykazovanými v přiznáních k daním z příjmů.
V oblasti DPH dominují kontroly zaměřené na nárok na odpočet DPH. Finanční správa přitom prověřovala jak prokázání nároku na odpočet, tak zapojení daňových subjektů do podvodných řetězců.
V rámci daně z příjmů právnických osob se finanční správa zaměřila na subjekty provozující svou činnost prostřednictvím internetových platforem. Neméně významnou oblastí byly převodní ceny. Finanční správa v minulém roce dokonce spolupracovala s Univerzitou Karlovou na vytvoření rizikového modelu, který má správcům daně pomoci k ještě přesnějšímu zacílení kontrolních postupů. Výroční zpráva současně uvádí, že finanční správa pokračuje ve specializaci části svých pracovníků na oblast převodních cen.
Dále se finanční správa zaměřovala také na daňové dopady skupinových restrukturalizací. Z hlediska počtu mezinárodních dohadovacích řízení k zamezení dvojího zdanění týkajících se převodních cen řešila finanční správa v roce 2025 celkem 62 případů, což představuje téměř 20% nárůst oproti roku 2024.
Daňová kontrola dnes zdaleka nekončí na hranicích České republiky. Finanční správa při správě daní využívá také informace získané ze zahraničí a spolupracuje s daňovými správami dalších států. Jen v rámci oznamovací povinnosti digitálních platforem získala v roce 2025 přibližně 156 tisíc záznamů o českých prodejcích, zatímco téměř 10 tisíc záznamů předala svým zahraničním partnerům.
V roce 2025 pokračovala finanční správa v modernizaci svých elektronických systémů.
V systému byly provedeny úpravy, díky nimž bude úrok z nesprávně stanovené daně vrácen automaticky, bez nutnosti podání žádosti daňovým subjektem.
Automatizace se dotkla také vymáhání daňových pohledávek. Díky novele zákona o finanční správě lze nyní nedoplatky vymáhat celorepublikově.
Výroční zpráva potvrzuje několik trendů, které budou s vysokou pravděpodobností ovlivňovat činnost finanční správy i v dalších letech. Za nejdůležitější považujeme zejména následující trendy:
Semináře, webcasty, pracovní snídaně a další akce pořádané společností Deloitte.
